La ventunesima edizione della gara maschile Under-23 dei Campionati del mondo di ciclocross 2016 si svolse il 31 gennaio 2016 con partenza ed arrivo da Heusden-Zolder in Belgio, su un percorso totale di 19,66 km. La vittoria fu appannaggio del belga Eli Iserbyt, il quale terminò la gara in 51'18", precedendo il ceco Adam Ťoupalík e il connazionale Quinten Hermans terzo.
Partenza con 52 ciclisti provenienti da 20 nazioni, dei quali 51 portarono a termine la competizione.