La prima versione uscita è quella con Motorola 68040; a partire dal marzo 1993 uscì anche la versione con Motorola 68EC030, il Commodore Amiga 4000/030. Come conseguenza, la versione con Motorola 68040, inizialmente chiamata Commodore Amiga 4000, è stata rinominata Commodore Amiga 4000/040.
Descrizione
L'Amiga 4000 si presenta in case desktop con due periferiche in dotazione: una tastiera alfanumerica e un mouse a due tasti. Il displayvideo, necessario per l'utilizzo dell'Amiga 4000, non è compreso.
A differenza dei precedenti modelli di personal computer Amiga, le prime serie di Amiga 4000 avevano il microprocessore montato su scheda separata dalla scheda madre, cosa che consentiva la sostituzione dello stesso mediante schede CPU di Commodore International o di terze parti.
In seguito, nel tentativo di ridurre i costi, venne immessa sul mercato una versione di Amiga 4000 con processore Motorola 68EC030 direttamente montato su scheda madre. Questa versione era conosciuta come A4000-CR (CR sta per Cost Reduced, in italiano "costo ridotto").