La 2. Fußball-Bundesliga 2008-2009 è stata la trentacinquesima edizione della 2. Fußball-Bundesliga, la seconda serie del campionato tedesco di calcio. È iniziata il 15 agosto 2008 ed è terminata il 24 maggio 2009, concludendosi con la promozione in Bundesliga del Friburgo, che ha vinto il torneo, il Magonza e il Norimberga; quest'ultimo ha vinto lo spareggio con l'Energie Cottbus.
Capocannonieri del torneo sono stati Benjamin Auer dell'Alemannia Aachen, Cédric Makiadi del Duisburg e Marek Mintál del Norimberga, tutti con 16 gol[1].
Le 18 squadre partecipanti alla edizione 2008-2009
Energie Cottbus 16º classificato Bundesliga 2008-2009 - Norimberga 3º classificato 2. Bundesliga 2008-2009
Energie Cottbus retrocesso, Norimberga in 1. Bundesliga
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