Vezetésével készült el a kor legjobb csillagtérképe. Feldolgozta az 1761-es és 1769-es Vénusz-átvonulások adatait, s ezekből kiszámította a Nap-Föld-távolságot.
Encke-üstökös
Az Encke-üstökös a leggyakrabban megfigyelt üstökös, pályája erősen elnyúlt ellipszis. 1818-ban Jean-Louis Pons francia csillagász fedezte föl, nevét Johann Franz Enckéről kapta, aki a rövid periódusú üstökösök pályájának kiszámításával ma is ismeretes a csillagászok között.