Kao šesnaestogodišnjak prešao je u srpnju 2019. iz Chelseaja u Bayern München.[8][9] Za Bayern München II, Bayernovu drugu momčad koja se natječe u 3. Ligi, debitirao je 3. lipnja 2020. i to protiv kluba Preußen Münster koji je poražen 3:2.[10] Sedamnaest dana kasnije debitirao je za prvu momčad u utakmici Bundeslige u kojoj je Freiburg izgubio 3:1. Tada je imao 17 godina i 115 dana te je postao najmlađi igrač u povijesti Bayerna koji je igrao u Bundesligi.[11][12] Dana 18. rujna 2020. postigao je svoj prvi klupski pogodak i to u ligaškoj utakmici u kojoj je Schalke poražen s visokih 8:0. Tada je Musiala imao 17 godina i 205 dana te je postao najmlađi strijelac u klupskoj povijesti. Do tada je rekord držao Roque Santa Cruz koji je imao 18 godina i 12 dana kada je postavio rekord.[6][13] Musiala je u UEFA Ligi prvaka debitirao 3. studena kada je Red Bull Salzburg poražen 2:6.[14] Svoj prvi pogodak u tom natjecanju postigao je 23. veljače 2021. kada je Lazio izgubio 1:4 od Bayerna. Musiala je tada postao najmlađi engleski i njemački strijelac u povijesti UEFA Lige prvaka.[15][16]
Reprezentativna karijera
Musiala je nastupao za omladinske selekcije Njemačke i Engleske.
Za A selekciju Njemačke debitirao je 25. ožujka 2021. kada je Njemačka pobijedila Island 3:0.[17] Dana 19. svibnja imenovan je članom njemačke momčadi za odgođeno Europsko prvenstvo 2020.[18] Na tom natjecanju debitirao je 23. lipnja i to protiv Mađarske s kojom je Njemačka igrala 2:2. Musiala je tada imao 18 godina i 117 dana te je time postao najmlađi njemački nogometaš u povijesti koji je zaigrao na nekom velikom natjecanju.[19] Svoj prvi gol za reprezentaciju postigao je 11. listopada 2021. u utakmici protiv Sjeverne Makedonije koja je završila 0:4.[20]
Priznanja
Individualna
Član najbolje momčadi svijeta do 20 godina prema izboru IFFHS-a: 2021.[21]