עונת 1949/1950 הייתה העונה הראשונה והיחידה של הליגה המיוחדת בכדורגל בישראל. זו הייתה העונה הראשונה לאחר הכרזת עצמאות והעונה ה-11 כאשר הספירה מתחילה מתחילת העונות הסדירות בתקופת המנדט. הליגה הייתה הליגה השנייה בחשיבותה לאחר הליגה הישראלית וכללה 45 קבוצות שהתחרו בחמישה בתים. בעקבות תוצאות העונה, אף קבוצה לא הועלתה לליגה הבכירה אך מספר קבוצות ירדו לליגה נמוכה ותחרות של עונת 1951/1952 כללה 26 קבוצות בלבד.
על ניצחון במשחק הוענקו שתי נקודות ונקודה בודדת הוענקה על תיקו.