פרס יפן (ביפנית: 日本国際賞; "פרס יפן הבין־לאומי") מוענק לאנשים מכל חלקי העולם אשר השיגו "הישגים מקוריים ויוצאי דופן במדע וטכנולוגיה אשר מוכרים כמקדמים את גבולות הידע ומשרתים את המטרה של שלום ושגשוג עבור המין האנושי". הפרס מיוצג על ידי קרן פרס יפן. מאז הקמתה ב־1985 ועד 2024 הקרן העניקה את הפרס ל־111 אנשים מ־15 מדינות.[1]
הפרס מורכב מתעודה, מדליה וסכום כספי של 100 מיליון ין (החל משנת 2020). בפרס יכולים לזכות רק אנשים חיים, ללא הגבלת אזרחות, גזע או מין. מדי שנה בחודש נובמבר בוחרת קרן הפרס שני תחומים שבהם יינתן הפרס בהתאם למגמות במדע ובטכנולוגיה. תהליך העמדת המועמדות והבחירה אורך כשנה, כשעל הזוכים מודיעים בחודש ינואר.
במעמד הענקת הפרס היוקרתי נערך טקס בהשתתפותם של קיסר יפן והקיסרית, ראש ממשלת יפן, ראש בית הנבחרים של יפן, נשיא בית היועצים של יפן, נשיא בית המשפט העליון של יפן ובכירים נוספים, לצד אנשי אקדמיה, חוקרים ואנשי עסקים.
בפרס זכו הישראלים אפרים קציר (1985) ועדי שמיר (2017).