ב-7 ביולי2008 נערכה מתקפת טרור בקאבול, היעד של הפיגוע היה שגרירות הודו. כתוצאה מהתקיפה נהרגו 58 בני אדם, יותר מ-100 נפצעו בדרגות חומרה שונות. ב-8 באוקטובר2009, טרוריסטים תקפו שוב את שגרירות הודו בקאבול. כתוצאה מהתקיפה נהרגו 17 בני אדם, עוד 63 נפצעו בדרגות חומרה שונות. הטליבאן לקח אחריות על שני הפיגועים. לאחר האירועים הללו, משרד החוץ של אפגניסטן הצהיר כי הודו היא מדינה אחות ושום אויב לא יכול להרוס את היחסים ביניהם. בשנת 2011, היחסים בין אפגניסטן להודו קיבלו תנופה חזקה לפיתוח בקשר לחתימת הסכם השותפות האסטרטגית, אשר היה ההסכם הבילטרלי הראשון בין אפגניסטן מאז הפלישה הסובייטית ב-1979. בשנת 2010 פרסמה גאלופ נתונים ש-75% מהאפגנים מרגישים טוב יותר לגבי הודו מאשר ארצות הברית וסין, ו-50% מהאפגנים מביעים שביעות רצון מלאה מהמדיניות של הודו, שהיא הדירוג החיובי ביותר להודו מבין כל מדינות אסיה-פסיפיק.
בנובמבר 2023 הודיעה שגרירות אפגניסטן בדלהי כי תפסיק להעניק שירות, עקב "קשיים נמשכים" מהודו.[1]
