Familia ETS
Familia ETS |
---|
Estrutura da autoinhibición da unión ao ADN de Ets-1. [1] | Identificadores |
---|
Símbolo | Ets |
---|
Pfam | PF00178 |
---|
Pfam clan | CL0123 |
---|
InterPro | IPR000418 |
---|
SMART | SM00413 |
---|
PROSITE | PDOC00374 |
---|
SCOPe | 1r36 / SUPFAM |
---|
Estruturas proteicas dispoñibles: |
---|
Pfam
| estruturas / ECOD
|
---|
PDB | RCSB PDB; PDBe; PDBj |
---|
PDBsum | resumo de estruturas |
---|
PDB | 1awc, 1bc7, 1bc8, 1dux, 1fli, 1gvj, 1hbx, 1k6o, 1k78, 1k79, 1k7a, 1md0, 1mdm, 1pue, 1r36, 1wwx, 1yo5, 2nny, 2stt, 2stw |
---|
|
En bioloxía molecular, a familia ETS (do inglés E26 transformation-specific, específica de transformación E26[2] ou E-twenty-six, E-vinte e seis[3]) é unha das maiores familias proteicas de factores e transcrición e é exclusiva dos metazoos. Hai 29 xenes en humanos, 28 en ratos, 10 no verme Caenorhabditis elegans e 9 na mosca Drosophila que codifican estas proteínas. O membro co que se fundou a familia identificouse como un xene transducido polo virus leucemia, E26. Os membros da familia están implicados no desenvolvemento de diferentes tecidos e na progresión do cancro.
Subfamilias
A familia ETS está dividida en 12 subfamilias, que son as da táboa:[4]
Subfamilia
|
Membros da familia en mamíferos
|
Ortólogos en invertebrados
|
ELF
|
ELF1, ELF2 (NERF), ELF4 (MEF)
|
|
ELG
|
GABPα
|
ELG
|
ERG
|
ERG, FLI1, FEV
|
|
ERF
|
ERF (PE2), ETV3 (PE1)
|
|
ESE
|
ELF3 (ESE1/ESX), ELF5 (ESE2), ESE3 (EHF)
|
|
ETS
|
ETS1, ETS2
|
POINTED
|
PDEF
|
SPDEF (PDEF/PSE)
|
|
PEA3
|
ETV4 (PEA3/E1AF), ETV5 (ERM), ETV1 (ER81)
|
|
ER71
|
ETV2 (ER71)
|
|
SPI
|
SPI1 (PU.1), SPIB, SPIC
|
|
TCF
|
ELK1, ELK4 (SAP1), ELK3 (NET/SAP2)
|
LIN
|
TEL
|
ETV6 (TEL), ETV7 (TEL2)
|
YAN
|
Estrutura
Todos os membros da familia ETS identifícanse por teren un dominio de unión ao ADN altamente conservado, chamado dominio ETS, que é unha estrutura de tipo hélice alada-xiro-hélice que se une a sitios do ADN cunha secuencia de ADN central GGA(A/T). Ademais das súas funcións de unión ao ADN, as evidencias suxiren que o dominio ETS está tamén implicado nas interaccións proteína-proteína. Fóra do dominio de unión ao ADN ETS a semellanza de secuencia é limitada.
Están presentes tamén outros dominios, que varían dun membro da familia ETS a outro, como o dominio Pointed, dunha subclase da familia do dominio SAM.
Función
Proteínas da familia ETS están presentes en todo o corpo e están implicadas nunha ampla variedade de funcións, incluíndo a regulación da diferenciación celular, o control do ciclo celular, a migración celular, a proliferación celular, a apoptose (morte celular programada) e a anxioxénese.
Moitos factores da familia ETS están asociados co cancro, xeralmente por medio de fusión xénica. Por exemplo, o xene ERG do factor de transcrición ETS ERG está fusionado co xene EWS, e como resultado orixínase unha condición chamada sarcoma de Ewing.[5] A fusión de TEL coa proteína JAK2 debida á fusión dos seus xenes causa unha leucemia linfoide aguda pre-B temperá.[6] ERG e ETV1 son xenes fusionados coñecidos no cancro de próstata.[7]
Ademais, factores Ets, por exemplo o Etv1 de vertebrados e o Ast-1 de invertebrados, son importantes actores na especificación e diferenciación das neuronas dopaminérxicas tanto en C. elegans coma nos bulbos olfactorios dos ratos.[8]
Modo de acción
Entre os membros da familia ETS, hai unha gran conservación no dominio de unión ao ADN ETS e, por tanto, moita redundancia na unión ao ADN. Crese que as interaccións con outras proteínas son unha maneira pola cal se consegue a unión específica ao ADN.[9]
Os factores ETS actúan como represores transcricionais, activadores transcricionais ou ambas as cousas.[10]
Notas
- ↑ Lee GM, Donaldson LW, Pufall MA, et al. (February 2005). "The structural and dynamic basis of Ets-1 DNA binding autoinhibition". J. Biol. Chem. 280 (8): 7088–99. PMID 15591056. doi:10.1074/jbc.M410722200.
- ↑ Nunn, M. F.; Seeburg, P. H.; Moscovici, C.; Duesberg, P. H. (1983). "Tripartite structure of the avian erythroblastosis virus E26 transforming gene". Nature 306 (5941): 391–395. PMID 6316155. doi:10.1038/306391a0.
- ↑ Leprince, D.; Gegonne, A.; Coll, J.; De Taisne, C.; Schneeberger, A.; Lagrou, C.; Stehelin, D. (1983). "A putative second cell-derived oncogene of the avian leukaemia retrovirus E26". Nature 306 (5941): 395–397. PMID 6316156. doi:10.1038/306395a0.
- ↑ Gutierrez-Hartman A, Duval DL, Bradford AP (2007). "ETS transcription factors in endocrine systems". Trends Endocrinol Metab 18 (4): 150–8. PMID 17387021. doi:10.1016/j.tem.2007.03.002.
- ↑ Ida K, Kobayashi S, Taki T, Hanada R, Bessho F, Yamamori S, Sugimoto T, Ohki M, Hayashi Y (1995). "EWS-FLI-1 and EWS-ERG chimeric mRNAs in Ewing's sarcoma and primitive neuroectodermal tumor". Int J Cancer 63 (4): 500–4. PMID 7591257. doi:10.1002/ijc.2910630407.
- ↑ Peeters P, Raynaud SD, Cools J, Wlodarska I, Grosgeorge J, Philip P, Monpoux F, Van Rompaey L, Baens M, Van den Berghe H, Marynen P (1997). "Fusion of TEL, the ETS-variant gene 6 (ETV6), to the receptor-associated kinase JAK2 as a result of t(9;12) in a lymphoid and t(9;15;12) in a myeloid leukemia". Blood 90 (7): 2535–40. PMID 9326218.
- ↑ Tomlins SA, Rhodes DR, Perner S, Dhanasekaran SM, Mehra R, Sun XW, Varambally S, Cao X, Tchinda J, Kuefer R, Lee C, Montie JE, Shah RB, Pienta KJ, Rubin MA, Chinnaiyan AM (October 2005). "Recurrent fusion of TMPRSS2 and ETS transcription factor genes in prostate cancer". Science 310 (5748): 644–8. PMID 16254181. doi:10.1126/science.1117679.
- ↑ Flames N & Hobert O (2009). "Gene regulatory logic of dopaminergic neuron differentiation". Nature 458 (7240): 885–890. PMC 2671564. PMID 19287374. doi:10.1038/nature07929.
- ↑ Verger A, Duterque-Coquillaud M (2002). "When Ets transcription factors meet their partners". BioEssays 24 (4): 362–70. PMID 11948622. doi:10.1002/bies.10068.
- ↑ Sharrocks AD (2001). "The ETS-domain transcription factor family". Nat Rev Mol Cell Biol 2 (11): 827–37. PMID 11715049. doi:10.1038/35099076.
Véxase tamén
Bibliografía
- Blair DG, Athanasiou M (2000). "Ets and retroviruses - transduction and activation of members of the Ets oncogene family in viral oncogenesis". Oncogene 19 (55): 6472–81. PMID 11175363. doi:10.1038/sj.onc.1204046.
- Li R, Pei H, Watson DK (2000). "Regulation of Ets function by protein - protein interactions". Oncogene 19 (55): 6514–23. PMID 11175367. doi:10.1038/sj.onc.1204035.
- Mimeault M (2000). "Structure-function studies of ETS transcription factors". Crit Rev Oncog 11 (3–4): 227–53. PMID 11358268. doi:10.1615/critrevoncog.v11.i34.20.
- Oikawa T, Yamada T (2003). "Molecular biology of the Ets family of transcription factors". Gene 303: 11–34. PMID 12559563. doi:10.1016/S0378-1119(02)01156-3.
- Sementchenko VI, Watson DK (2000). "Ets target genes: past, present and future". Oncogene 19 (55): 6533–48. PMID 11175369. doi:10.1038/sj.onc.1204034.
- Verger A, Duterque-Coquillaud M (2002). "When Ets transcription factors meet their partners". BioEssays 24 (4): 362–70. PMID 11948622. doi:10.1002/bies.10068.
- Nunn M, Seeburg P, Moscovici C, Duesberg P (1983). "Tripartite structure of the avian erythroblastosis virus E26 transforming gene". Nature 306 (5941): 391–95. PMID 6316155. doi:10.1038/306391a0.
|
|