Kučera commence sa carrière au Chmel Blšany. À 16 ans, il part au AC Sparta Prague et est intégré au noyau A en 2003. Il joue peu et en , il est prêté au FK Jablonec 97. En , après un bon premier tour, le AC Sparta Prague le rappelle au club. En fin de saison, il quitte la Tchéquie et s'engage au FC Bruges. Il réalise une excellente préparation mais, juste avant le début de la compétition, il se blesse lors de la Supercoupe de Belgique contre le RSC Anderlecht. Après cette blessure, il a beaucoup de mal à s'imposer.