L'éparchie de Bakou et d'Azerbaïdjan (en azéri: Bakı və Azərbaycan yeparxiyası) est une éparchie de l'Église orthodoxe russe, réunissant les chrétiens orthodoxes sur le territoire de l'Azerbaïdjan avec son centre à Bakou[1].
L'orthodoxie commence à se répandre en Azerbaïdjan au XIXe siècle avec l'apparition de la population russe en Azerbaïdjan à la suite du transfert du territoire sur lequel se trouve l'Azerbaïdjan moderne de la Perse à la Russie en vertu du traité de Turkmanchay (1828).
Le dernier évêque qui porte le titre de « Stavropol et Bakou » est le métropolite Gédéon (Dokukin). En 1998, le Saint-Synode décide de séparer le doyenné de Bakou de la métropole de Stavropol et de créer une éparchie indépendante de Bakou. Le 28 décembre 1998, l'ecclésiastique de l’éparchie de Stavropol, doyen des paroisses orthodoxes d'Azerbaïdjan, l'archimandrite Alexandre (Ishchein), est nommé évêque de Bakou et de la mer Caspienne. Le 14 janvier 1999, il est consacré évêque. Par décision du Saint-Synode du 22 mars 2011, les paroisses du territoire du Daghestan, qui faisait partie de l’éparchie de Bakou, sont attribuées à l’éparchie nouvellement formée de Vladikavkaz et Makhatchkala. La division en doyennés qui existait auparavant a été supprimée par une décision du Conseil éparchial dès 22 septembre 2022.