Militant du groupe marxiste Socialisme ou barbarie à partir de 1964, il est ensuite très investi dans la revue Arguments, animée par Edgar Morin, Kostas Axelos et Jean Duvignaud. Il se consacre ensuite à l'autogestion, dont il fait la promotion par le biais d'une revue qui porte ce nom.
Yvon Bourdet a écrit dans la revue Études de marxologie dirigée par Maximilien Rubel, ainsi que dans Arguments et Autogestion et socialisme.
Publications
Communisme et marxisme, notes critiques de sociologie politique, M. Brient et Cie, 1963
La délivrance de Prométhée : pour une théorie politique de l'autogestion, Éditions Anthropos, 1970