Après avoir commencé la saison 2012 à Nashville, Peralta est rappelé pour la première fois par les Brewers pour remplacer temporairement Kameron Loe dans leur effectif[2]. Peralta fait ses débuts dans le baseball majeur avec les Brewers de Milwaukee le par une présence comme lanceur de relève. Il enchaîne 5 départs dans le dernier mois de la saison régulière et lance 29 matchs. Il encaisse une défaite et remporte deux victoires, dont sa première à son premier départ pour les Brewers, le face aux Marlins de Miami[3].
En 2013, Peralta intègre la rotation de lanceurs partants des Brewers et amorce 32 rencontres. En 183 manches et un tiers lancées, sa moyenne de points mérités se chiffre à 4,37 avec 11 victoires et 15 défaites.