Pendant son mandat, il est critiqué pour avoir invité des personnalités pro-choix comme Robert DrinanS.J. et l'actrice Marlo Thomas à parler à l'église durant des événements parrainés, ainsi que pour avoir dit la messe pour les gays et les lesbiennes à Chicago en 1992. Il doit faire face à une baisse drastique des vocations et de la pratique dans son diocèse.