La région fut colonisée par des bandeirantes à la recherche d’or, de pierres précieuses et d’indiens pour les réduire en esclavage. Des cultivateurs ont aussi été attirés par la terre fertile.
Citons les principales dates de l’histoire de cette cité. Cette histoire est étroitement liée à celle de Bragança Paulista .
1720 : Début du peuplement
1778 : cession de terres à João Rodrigues Antunes
1789 : cession de terres à João Francisco de Oliveira
1884 : installation de la Compagnie de Chemin de Fer São Paulo Railway avec Vargem comme dernière gare du système. Ce chemin de fer fut un grand facteur d’intégration et provoqua le développement de l’élevage sur son axe.
1929 : Vargem est créé district de Bragança Paulista alors appelé Bragança tout court.
1959 : inauguration de l’autoroute Fernão Dias et subséquente désactivation du chemin de fer. Ce fait, allié à la baisse de la production du café provoque une diminution de l’activité économique.
1964 première transformation du district en municipalité
1970 Vargem redevient district annexé à la municipalité de Bragança Paulista
