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Ancien membre de l'USM Olivet puis du VS Chartres[3], Sébastien Hatton intègre la réserve de la formation Aubervilliers 93-Peugeot en 1996. Il passe professionnel dans cette équipe en 1997, après y avoir été stagiaire. Bon sprinteur, il se classe deuxième d'une épreuve de la Mi-août bretonne et d'une étape au Tour du Japon. Il termine également troisième de la dernière étape du Tour de l'Avenir.
Non conservé par ses dirigeants, il redescend chez les amateurs en 1999.
