Né à Toulon le 13 août 1959, d'un père artiste lyrique à l'Opéra de Paris, Philippe Bonifay est d'abord comédien de théâtre (Théâtre des embruns, dans le Val d'Oise & Les Sclazacani, à Paris) puis écrit pour la scène. C'est sa rencontre avec le dessinateur Christian Rossi qui lui inspire l'intention d'écrire pour la bande dessinée. Il devient scénariste de BD de 1980 à 2014, date à laquelle il annonce officiellement sa décision d'arrêter cette activité, dans un environnement de politique éditoriale qui ne lui convient plus.
Il a collaboré à divers ouvrages, comme Kathleen (dessin Rossi), Mon voisin le Père Noël (dessin : Tillier) ou encore Zoo (dessin : Frank). Il s'est intéressé aux récits d'aventures avec Pirates (dessin : Jacques Terpant)[1] et Gitans des mers (dessin : Duval).
Il a lancé en 2005, avec le dessinateur Youssef Daoudi la Trilogie noire (Casterman), adaptation du cycle de romans du même nom de Léo Malet[2]. Ses trois derniers titres, parus chez Glénat, dérivent de contes : Blanche Neige (dessin Fabrice Meddour), Barbe Bleue (dessin Duval) et, en 2013, Pinocchio (dessin Thibaud De Rochebrune).
En Guyane où il habite depuis 2010, il revient au spectacle vivant et au cinéma. Il crée et met en scène Maskilili et l'oiseau du Paradis, un spectacle interprété par des danseurs, des musiciens, des art-plasticiens, des chanteurs et des comédiens, représentant la Guyane Française lors d'un festival à Georgetown (Guyana), l'été 2012[réf. nécessaire], réalise des films de prévention et des films institutionnels.