La nonciature possède un double rôle. D'une part, elle assure le lien entre Rome et l'Église de Suisse et en particulier la Conférence des évêques suisses. À ce titre, le nonce prépare les dossiers de nominations d'évêques en Suisse. D'autre part, en tant qu'ambassade du Saint-Siège, la nonciature assure les relations diplomatiques avec les autorités civiles helvétiques.
Depuis 1987, le nonce en Suisse est également accrédité auprès du Liechtenstein.