Il entame des études de biologie, physique et chimie avant de rejoindre le Hamas en 1987. Il est arrêté en 1989 par les autorités israéliennes, puis libéré seize mois plus tard[4]. Il devient chef des brigades al-Qassam en 2002, à la suite du décès de son prédécesseur, Salah Shehadeh[5].
Bien qu'il soit l'homme « le plus recherché » par l'armée israélienne depuis 1995, pour avoir orchestré les meurtres de soldats et de civils israéliens, il survit à au moins huit tentatives d'assassinat au cours des dernières décennies[4]. Il a déjà été donné pour mort plusieurs fois par Israël[6].
Ainsi, le , l'aviation israélienne frappe une maison dans laquelle se trouverait, selon ses informations, Mohammed Deïf. Israël estime qu'il aurait été tué ou grièvement blessé, le Hamas a démenti cette information. La femme et la fille de Deïf sont tuées dans le bombardement. Mohammed Deïf est fortement diminué, étant amputé des deux jambes et d'un bras. Il a également perdu la vision d'un œil[7],[8].
Il est visé par un bombardement israélien le 13 juillet 2024 dans le camp de réfugié d'Al-Mawasi. Après le bombardement, qui tue au moins 90 personnes et fait 300 blessés selon le ministère de la Santé de Gaza, Benjamin Netanyahu déclare n'avoir « aucune certitude » sur le sort de Mohammed Deïf[12]. Le quotidien israélien Yediot Aharonot écrit que Tsahal a procédé à plusieurs phases de bombardements, créant un « cercle de feu » autour du site afin d'empêcher les secouristes d'atteindre les lieux et de porter secours à Mohammed Deïf et aux autres victimes. Scott Anderson, le directeur à Gaza de l'UNRWA, a fait état de plus de 100 blessés sévères, expliquant que « nombre de patients ont été traités à même le sol, sans désinfectant » et décrivant « des bébés amputés de deux membres, des enfants paralysés, incapables de recevoir un traitement, et d'autres séparés de leurs parents ». Le nombre considérable de victimes est notamment lié au fait que les autorités israéliennes avaient déclaré l'endroit comme étant une « zone humanitaire », poussant des milliers de familles à s'y réfugier[13].
Le , l'armée israélienne annonce qu'à la suite d'une analyse de renseignements « il peut être confirmé que Mohammed Deïf a été éliminé » lors des frappes du dans la région de Khan Younès[3], qui ont fait au moins 90 morts selon les autorités palestiniennes[14].
↑« Guerre Israël-Hamas : une frappe israélienne visant Mohammed Deïf, le chef militaire du Hamas, cause un carnage à Gaza », Le Monde.fr, (lire en ligne, consulté le )
↑« Gaza : des dizaines de tués, lors de frappes visant des responsables du Hamas », Le Monde.fr, (lire en ligne, consulté le )
↑« Guerre Israël-Hamas : une frappe israélienne visant Mohammed Deif, le chef militaire du Hamas, cause un carnage à Gaza », Le Monde, (lire en ligne, consulté le )