Au terme de la saison 2001-2002, les Islanders échangent Czerkawski aux Canadiens de Montréal. Il s'agit une saison décevante pour le Polonais, qui ne marque que 5 fois en 43 matchs et pire encore, les Canadiens le reléguèrent à leur club-école, les Bulldogs de Hamilton de la Ligue américaine de hockey (LAH). Le club rachète son contrat au terme de la saison, et Czerkawski s'entend pour un contrat d'un an avec les Islanders. L'atmosphère new-yorkaise lui fait le plus grand bien ; il redevint lui-même et marque 25 buts et 24 passes.
Pendant le lock-out 2004-2005, Czerkawski joue dans l'Elitserien avec Djurgården ; il revient dans la LNH la saison suivante avec les Maple Leafs de Toronto. Passant le plus clair du premier quart de la saison sur le banc et dans les gradins à cause de performances douteuses et d'une blessure à l'épaule, il a un regain de vie et joue sur le premier trio en compagnie de Mats Sundin. Il marque au cours de 3 matches d'affilée en décembre, avant de passer les trois matches suivants blanchi. Il récoltera un maigre quatre buts et une passe en 16 matchs. Les Bruins le réclament au ballottage le .
À l'été 2006, il signe un contrat avec le club suisse de Rapperswil. Il y joue deux saisons avant de prendre sa retraite en 2008.
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Prix individuels et d'équipe
La Złoty Kij(pl) (1991), sondage annuel pour désigner le meilleur joueur de hockey en Pologne (le plus jeune joueur de l'histoire à l'âge de 19 ans)
Coupe d'Europe et le vice-champion de Suède sous les couleurs du Djurgårdens IF (1992)
Performance record (et le meilleur buteur) de l'Allsvenskan ligue davec le Hammarby IF - 93 points en 45 matchs (1993), le même exploit est toujours invaincue
Participation à des compétitions Elitserien All-Star Game (1994)
La troisième place dans le classement des assistants et le cinquième rang des marqueurs de recrue dans la catégorie dans la LNH la saison 1994-1995 sous les couleurs des Bruins de Boston
Le « Islander de l'Année 2000 » avec les Islanders de New York
Performance dans le Match des étoiles de Toronto (2000), récoltant un point (une aide sur le but de Miroslav Šatan)
Meilleur buteur avec les Islanders de New York (1999, 2000, 2004)
Meilleur buteur avec les Rapperswil-Jona Lakers (2007, 2008)
Le titre « Superchampion » dans la révision du sport plébiscite pour des réalisations à vie du sport (2008)
Le « Palet d'Or », prix des journalistes de TVP Sport (télé), Magazin Hokej (presse écrite) et Sport24.pl (Internet) pour l'ensemble de sa carrière et des activités pour le développement du hockey en Pologne (2009)