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En 2015, elle est, derrière Simone Biles, la meilleure gymnaste américaine, remportant deux médailles aux championnats du monde. La même année, elle est la première à dénoncer auprès de la fédération américaine les abus sexuels perpétrés par le médecin Larry Nassar, mais sa plainte est d'abord étouffée et l'affaire commence vraiment lorsque le journal The Indianapolis Star révèle les premiers témoignages en , aboutissant plus tard à la condamnation de Nassar en . Entre-temps Maggie Nichols, malgré ses performances, n'est pas retenue pour faire partie de l'équipe olympique américaine en 2016. Elle décide alors de quitter l'élite pour poursuivre sa pratique de la gymnastique au sein du championnat universitaire, remportant de plusieurs titres individuels ou par équipes avec les Sooners de l'Oklahoma.