Cette liste comprend les aires protégées et les territoires de conservation de la faune et de la flore situés au Bas-Saint-Laurent au Québec.
Au niveau fédéral, les aires protégées comprennent les parcs nationaux, les refuges d'oiseaux migrateurs, les réserves marines de faune, les réserves nationales de faune, les sites canadiens et les zones de protection marine. À l'exception des deux derniers, le territoire du Bas-Saint-Laurent comprend au moins une aire protégée de chaque catégorie.
Au niveau provincial, il existe six types d'aires protégées placées sous la responsabilité du ministère du Développement durable, de l'Environnement, de la Faune et des Parcs : cinq en vertu de la Loi de la conservation du patrimoine naturel et un en vertu de la Loi sur les espèces menacées ou vulnérables. Le Bas-Saint-Laurent comprend trois réserves écologiques et quatre réserves naturelles qui sont sous la première loi ainsi que six habitats floristiques qui sont sous la seconde loi et qui protègent des espèces floristiques menacées ou vulnérables[1].
Les réserves fauniques et les zones d'exploitation contrôlée (zec) sont des territoires qui sont gérés afin de rendre la chasse et la pêche accessibles tout en ayant pour mission la conservation de la faune. Les réserves fauniques sont gérées par le ministère des Ressources naturelles du Québec tandis que les zec sont gérées par des organismes à but non lucratif.
De plus, les zones importantes pour la conservation des oiseaux sont définis par l'organisation internationale BirdLife International et le Bas-Saint-Laurent en comprend dix dont trois sont également des refuges d'oiseaux migrateurs protégés.
Il y a quatre réserves naturelles reconnues dans la région[2]:
Il y a 26 écosystèmes forestiers exceptionnels au Bas-Saint-Laurent[3]: