En , au cours d'une session du Parlement tibétain en exil, Karma Chophel déclara que le dalaï-lama recherchait peut-être l'autonomie du Tibet mais qu'il avait en fait l'indépendance à cœur. Devant la controverse suscitée par cette déclaration, Karma Chophel s'est toutefois rétracté et a présenté ses excuses au dalaï-lama[6]. Karma Chophel fit cette remarque alors qu'il annonça le retrait de son soutien à la politique officielle tibétaine de la « voie du milieu » recherchant un accord mutuellement bénéfique avec la République populaire de Chine, et prôna la restauration du statut historique d'Etat souverain et indépendant du Tibet[7]. Le dalaï-lama démentit l'interprétation de Karma Choephel[4].
Il est mort à 66 ans à Dharamsala d'une longue maladie avec infection pulmonaire[4].
↑Mathieu Vernerey, La démocratie tibétaine à l'épreuve : pour une autre politique en exil. Entretien avec Karma Choephel, Diplomatie, juillet 2013, p. 50