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Son livre sur le néoconservatisme américain, paru en anglais sous le titre Neoconservatism. The Biography of a Movement (Harvard University Press, 2010)[6], est considéré comme « une lecture essentielle pour quiconque souhaite déchiffrer les contours de notre histoire politique récente » selon la critique du New York Times[7].
De 2007 à 2013, il est Senior Fellow puis Director of Research au Center on the US and Europe de la Brookings Institution à Washington[8], le think tank américain le plus influent. À ce poste, il a notamment initié plusieurs projets, comme le European Foreign Policy Scorecard, projet d'évaluation des performances européennes sur la scène diplomatique mondiale et de la capacité à projeter son influence, en coopération avec le think tank ECFR.
En , le ministre des Affaires étrangères Laurent Fabius le choisit[2] pour diriger le Centre d'analyse, de prévision et de stratégie (CAPS), la nouvelle incarnation du Centre d'Analyse et de Prévision créé par Michel Jobert en 1973, et que le ministre souhaite orienter davantage vers la recommandation politique. Le CAPS a vocation à couvrir l'ensemble des sujets dont s'occupe la diplomatie française ; il a la double mission d'assurer l'interface avec le monde de la recherche sur les questions internationales et de servir aussi bien de centre d'analyse et de conseil stratégique que de « poil à gratter » pour le ministre et le ministère des Affaires étrangères, avec une attention particulière portée sur l'anticipation et la prospective[9]. Il est en cela l'équivalent du Policy Planning Staff américain.
Depuis 2018, le Forum de Paris sur la paix est le lieu où les chefs d'État et les organisations internationales travaillent avec la société civile et le secteur privé à construire de nouvelles formes d'action collective. Ses deux premières éditions ont réuni plus de cent chefs d’États et de gouvernement, des centaines de PDG, d’ONG, de leaders d’opinion et de représentants de la société civile, et plus de 10 000 participants. Du 11 au , sa troisième édition sera principalement consacrée à la réponse multi-acteurs à la pandémie de la covid-19, avec la conviction que nous pouvons collectivement surmonter les énormes défis qui nous attendent et utiliser cette crise sanitaire comme une opportunité pour reconstruire un monde meilleur et plus durable[14].
États-Unis: le temps de la diplomatie transformationnelle, Cahier de Chaillot, no 95, [1].
La Politique étrangère des États-Unis : fondements, acteurs, formulation, en collaboration avec Charles-Philippe David et Louis Balthazar, (Presses de Sciences-Po, 2003; nouvelle édition 2008)
Washington et le monde : dilemmes d'une superpuissance, en collaboration avec Pierre Hassner, (CERI - Autrement, 2003)
L'Empire du milieu - les États-Unis et le monde depuis la fin de la guerre froide, en collaboration avec Pierre Mélandri, Odile Jacob, 2001, prix France-États-Unis 2001.
La Démocratie au XXe siècle : Europe de l'Ouest, États-Unis, 1918 – 1989, (sous la dir. de Marie-Anne Matard-Bonucci et préfacé par Serge Berstein), Atlande, Paris, 2000
Le modèle américain, A. Colin, 1998, 95 p., 18 cm. (ISBN2-200-01910-6)
Participation à d'autres ouvrages
L'Empire américain ?, sous la dir. de Michel Wieviorka, Balland, Paris, 2004 - actes des Entretiens d'Auxerre de .
Les Relations franco-américaines au XXe siècle : Colloque de l'Observatoire de la politique étrangère américaine, 24 et , sous la direction de Pierre Mélandri et de Serge Ricard, L'Harmattan, Paris, 2003
Guerres et sociétés : États et violence après la guerre froide, sous la dir. de Pierre Hassner et Roland Marchal, Karthala, Paris, 2003
↑Jean Klein, « Zbigniew Brzezinski. Stratège de l’empire, Justin Vaïsse, Paris, Odile Jacob, 2015, 424 pages », Politique étrangère, vol. 2016/3, , p. 158-159 (lire en ligne, consulté le )
↑https://www.elysee.fr/front/pdf/elysee-module-779-fr.pdf : "C'est pourquoi je souhaite que la France lance un cycle de conférences internationales annuelles diplomatiques et juridiques, consacrées à l'organisation de notre monde, la première se tiendra à Paris à l'été 2018"
