Mais le political general McClernand est rapidement éliminé par les soldats de métier. Ulysses S. Grant, soutenu par William Tecumseh Sherman (alors subordonné de facto de McClernand) et par l’amiral David Dixon Porter, démet McClernand le , après seulement 8 jours de commandement, et reprend la tête des opérations : c'est Grant qui dirige l’expédition contre Vicksburg.