Arbitre au premier but le , Joyce est impliqué dans une controverse alors qu'une mauvaise décision prive le lanceur des Tigers de DetroitArmando Galarraga d'un match parfait, un exploit rare. Après deux retraits en 9emanche et après que Galarraga eut retiré les uns après les autres les 26 frappeurs des Indians de Cleveland, Joyce déclare Jason Donald sauf au premier coussin alors que le relais du joueur de premier but des Tigers Miguel Cabrera à Galarraga après un faible roulant avait clairement devancé Donald. Joyce avoue sa faute et présente personnellement des excuses à Galarraga après la partie[1]. mais le baseball majeur refuse de renverser la décision une fois le match terminé. Lors du match du lendemain, où Joyce est l'arbitre au marbre, les deux hommes échangent une poignée de main[2]. Un an plus tard, Joyce et Galarraga collaborent à un livre de Daniel Paisner, Nobody's Perfect: Two Men, One Call and a Game for Baseball History, relatant l'affaire. Leur collaboration faisant d'eux des partenaires d'affaires, Joyce ne peut plus arbitrer de matchs auxquels Galarraga participe, puisque cela serait perçu comme un conflit d'intérêts[3].
Jim Joyce est intronisé en 2009 au Irish Baseball Hall of Fame, qui honore les personnalités du baseball ayant des origines irlandaises[4].
En 2010, ESPN sonde anonymement 100 joueurs de la Ligue majeure sur leur appréciation des arbitres, et Jim Joyce est celui qui obtient la meilleure note parmi les officiels du circuit[5].