Il succède à son père en 1687 comme surintendant et compositeur de la musique de la chambre du roi. Il meurt le à Paris et est inhumé en l'église Saint-Eustache.
Œuvres
Jean-Louis Lully participa avec son frère Louis à la composition de Zéphire et Flore (tragédie lyrique, 1688) et écrivit encore la partition d’Orontée la même année.