Håkan Lindquist commence sa carrière d'écrivain en 1993 avec Min bror och hans bror (publié en France sous le titre Mon frère et son frère, Gaïa Éditions, 2002), le récit d'un adolescent, Jonas, tentant de retracer la vie sentimentale de son frère Paul disparu avant sa naissance. Cette œuvre a été traduite en onze langues, et l'édition française a obtenu le « Prix littéraire de la Bordelaise de lunetterie ».
Le troisième roman de l'écrivain, De collectionner les timbres, est également publié en France (Gaïa Éditions, 2004).
Håkan Lindquist collabore également avec articles et critiques à diverses publications scandinaves, et a publié un certain nombre de nouvelles en Suède, France, Finlande, Islande, Hongrie et aux États-Unis. Il est aussi l'auteur du livret de l'opéra William (musique du compositeur B. Tommy Andersson), qui évoque la relation sentimentale (supposée) entre William Shakespeare et Christopher Marlowe. William a été représenté pour la première fois au château de Vadstena en .