Les députés décident alors de voter l'autodissolution de leur assemblée. Lors du scrutin parlementaire, les partis au pouvoir sont balayés et le parti populiste ANO 2011 émerge à la deuxième place des forces politiques.
Le , en conflit avec Andrej Babiš au sujet de soupçons de fraude fiscale pesant sur ce dernier, Sobotka annonce sa démission, devant entrainer celle de tout le gouvernement, afin de le remplacer au poste de ministre des Finances ou d'anticiper les élections législatives prévues à l'automne[1]. Il revient sur sa décision trois jours plus tard, le président Miloš Zeman refusant de considérer l'ensemble du gouvernement comme démissionnaire, et lui demande de révoquer seulement Andrej Babiš[2],[3].
