En junior, son record est 7 292 points réalisé au centre sportif Chaoyang de Pékin en 2006, pour une 13e place aux Championnats du monde junior. À Turin, il termine 8e et finaliste de l'heptathlon avec 5 886 points.
Par la suite, ses performances augmentent progressivement, année par année.
En , il prend part au décathlon de Cannes et termine deuxième derrière son compatriote Kevin Mayer (8 091 points), et bat son record en réalisant 8 027 points, franchissant ainsi pour la première fois la barrière des 8 000 points.
Les 27 et , Gaël Quérin participe aux Championnats d'Europe d'Helsinki. Lors de la première journée de compétition, il améliore son record personnel au saut en longueur avec 7,56 m. La deuxième journée est moins bonne avec un lancer du disque assuré, un lancer du javelot moyen et un 1 500 m inférieur à ses espérances. Mais son record au saut à la perche (5,00 m contre 4,96 m réalisés à Götzis précédemment) lui permet tout de même de réaliser 8 098 pts, total lui permettant de terminer 5e du classement général final. Cette performance lui permet de passer à la deuxième place des bilans français 2012 (il terminera l'année à la troisième place).
Les 18 et , il dispute le dernier décathlon de sa carrière professionnelle lors du meeting d'épreuves combinées de la Réunion à Saint-Paul. Il réalise, à cette occasion, 7 423 points tout en remportant la dernière épreuve de la compétition: le 1 500 mètres[1],[2],[3].