L'Australien Matt Williams a été démis de ses fonctions le . Frank Hadden a été nommé les jours suivants entraîneur intérimaire de l'équipe d'Écosse. Avant-dernier du Tournoi des six nations 2005 avec une seule victoire au compteur, le XV au chardon connaissait son troisième entraîneur en moins de deux saisons. Matt Williams avait en effet succédé en décembre 2003 à Ian McGeechan, qui avait terminé tristement : une dernière place au Tournoi des six nations 2004.
Frank Hadden a été nommé entraîneur officiellement le et a démissionné le , après la 5e place de l'Écosse dans le Tournoi des six nations 2009.
L'équipe première de l'école devint une des places fortes des écoles de rugby d'Écosse, Frank Hadden acquit une renommée comme entraîneur en puissance de rugby.
En 1992 il accepta son premier challenge national, quand il s'occupa de la sélection d'Écosse des moins de 16 ans. Tout en s'occupant des jeunes Écossais, Hadden débuta en 1997 comme entraîneur adjoint des Caledonian Reds, une des quatre nouvelles équipes professionnelles écossaises mises en place après le passage du rugby au statut professionnel.
Frank Hadden fit partie de la tournée de 1998 en Australie en qualité de conseiller technique. Mais la Fédération écossaise, la SRU, dut faire des économies de budget pour sauver les Reds, et Frank Hadden retourna à ses études.
Édimbourg Rugby
En 2000, quand une révolte des joueurs poussa vers la sortie Ian Rankin alors l'entraîneur d'Édimbourg Rugby, Frank Hadden accepta de quitter l'enseignement et fut entraîneur principal de l'équipe.
En 2004, il devint le premier entraîneur à qualifier une équipe professionnelle écossaise pour les quarts de finale de la Coupe d'Europe de rugby à XV.
Durant son passage à Édimbourg Rugby, l'équipe connut une montée en puissance.
Frank Hadden a dirigé 41 matches en tant qu'entraîneur de l'équipe d'Écosse.
Sur ces 41 matches, on compte 16 victoires pour 25 défaites, soit 39 % de victoires.
L'Écosse de Frank Hadden aura remporté des victoires sur des équipes de niveau moyen ou plus modeste, mais aura systématiquement buté sur les 3 grandes équipes de l'hémisphère sud: Nouvelle-Zélande, Afrique du Sud, Australie. Entre 2005 et 2009 l'Écosse aura cependant réalisé de bonnes performances à plusieurs reprises contre des équipes de haut niveau comme l'Angleterre en 2006 et 2008, la France en 2006, l'Irlande et le Pays de Galles en 2007 ou encore l'Argentine en 2008. L'Écosse de Frank Hadden a systématiquement dominé les équipes moins bien classées qu'elle.
En Coupe du monde :
3 victoires pour 2 défaites. Participation aux quarts de finale, battue 19-13 par l'équipe d'Argentine.
Plus large victoire : 66-19 contre les Barbarians, le ;
Plus large défaite : 0-40 contre la Nouvelle-Zélande, le
