La Fondation organise chaque année l'opération Pièces Jaunes, destinée à améliorer les conditions d'hospitalisation des enfants et des adolescents.
La Fondation agit auprès des patients, des soignants et des aidants à travers la subvention de projets, initiés par les hôpitaux publics, partout en France. Depuis sa création, plus de 15 500 projets ont été financés par la Fondation, dont plus de 9 000 en faveur des enfants et des adolescents et plus de 6 000 au profit des personnes âgées.
Pour promouvoir son action auprès du public et lui permettre de faire appel au don en confiance, la Fondation des Hôpitaux a adhéré au Comité de la Charte qui contrôle et garantit la transparence et l'utilisation des dons et legs qu'elle reçoit.
Pour cela, elle subventionne, grâce au soutien des donateurs, des projets conçus par des équipes hospitalières. En 2019, la Fondation a subventionné plus de 600 projets dans les hôpitaux publics français.
La Fondation organise également des Matinales, conférences mensuelles établissant un lien entre le monde de la santé et le grand public.
Le dernier contrôle financier de la Fondation est intervenu en 2017.
Par ailleurs, la Cour des comptes « a justifié pleinement la confiance qui lui était faite par ses donateurs » lors du dernier contrôle, en 2016[3].
Dans le contexte de la crise du Covid-19, le Mobilier national a annoncé qu'il vendra aux enchères un grand nombre de pièces de mobilier au bénéfice de la Fondation. Cette vente aura lieu lors des Journées du patrimoine des 20 et [4].
Depuis le mois de , la Fondation a engagé plus de 35 millions d'euros pour venir en aide aux hôpitaux et aux Ehpad à travers la France, et soutenir les soignants, les patients et les aidants faisant face à la crise sanitaire du Covid-19[5].