Il a étudié la médecine à l'Université Complutense, où il a réussi la maîtrise en 1931. Après la guerre civile espagnole, il prépare une chaire en chimie organique. Quand celle-ci pris fin, Faustino Cordón s'écarte de l'enseignement pour développer sa carrière professionnelle dans l'industrie privée consacré à l'investigation expérimentale.
De 1941 à 1945, il continue de travailler dans des laboratoires privés. Son directeur a été le docteur Fernando Calvet, ce qui lui a permis d'obtenir une bonne préparation en chimie expérimentale où il a appris à développer avec rigueur sa capacité d'observation dans les laboratoires.
En 1970, à son retour de Puerto Rico, il crée un Institut puis commence la rédaction d'un Traité évolutionniste en biologie.
