Elle se distingue lors des Championnats du monde en salle 1997 de Paris-Bercy en remportant le titre du 200 mètres devant la Jamaïcaine Juliet Cuthbert. Elle établit à cette occasion un nouveau record de Grèce en 22 s 76[1]. Elle atteint à deux reprises le podium des Jeux méditerranéens, se classant troisième du 100 m en 1993 et deuxième du 200 m en 1997.
En 1998, Ekateríni Kóffa monte sur la troisième marche du podium du 200 m des Championnats d'Europe en salle de Valence, derrière la Russe Svetlana Goncharenko et l'Allemande Melanie Paschke[2]. Elle participe par ailleurs aux Championnats du monde en plein air de 1995 et 1997 mais ne parvient pas à se qualifier pour la finale.
Ses meilleures performances sur 200 m sont de 22 s 67 en extérieur (Athènes, le ) et 22 s 71 en salle (Le Pirée, le ).
