Corynebacterium

Corynebacterium

Corynebacterium spp. observées au microscope optique après coloration de Gram

Classification LPSN

Domaine	Bacteria
Embranchement	Actinomycetota
Classe	Actinomycetes
Ordre	Mycobacteriales
Famille	Corynebacteriaceae

Genre

Corynebacterium
Lehmann & Neumann 1896

Corynebacterium (en français les Corynébactéries) sont un genre de bacilles Gram positif de la famille des Corynebacteriaceae. Ces bactéries sont très répandues dans l'environnement (air, sol, eau douce), chez l'animal (volailles, poissons) et l'être humain où elles abondent dans le microbiote cutané et dans certaines muqueuses.

Caractéristiques

Morphologie

Ces bactéries sont de forme irrégulière, en général de forme renflée à une extrémité (en massue). Leur mode de groupement particulier (en V, N, L ou en idéogrammes, en palissades) témoigne de leur division par fission binaire inégale. De plus, ils possèdent des granulations métachromatiques mises en évidence par la coloration d'Albert (absence de coloration).

Culture

Culture de Corynebacterium sur GTS.

Les Corynebacterium sont peu exigeants : ils sont cultivés sur milieu ordinaire et certaines espèces préférentiellement sur gélose au sang, donnant des colonies de type R sans relief.

Certaines espèces sont lipophiles (elles nécessitent des lipides pour leur croissance).

Caractères biochimiques

Ils possèdent une catalase et sont, pour la plupart, aéro-anaérobies facultatifs. Certaines espèces sont anaérobies strictes, notamment C. acnes (Propionibacterium acnes) et C. minutissimum. L'identification s'effectue par les méthodes habituelles (API Coryne, Vitek2, spectrométrie de masse).

Leur paroi contient de l'acide méso-diaminopimélique (méso-DAP) comme acide aminé de jonction dans son peptidoglycane^{[réf. nécessaire]}. Les principaux glucides présents dans la paroi sont l'arabinose et le galactose^{[réf. nécessaire]}. Les acides gras cellulaires sont majoritairement les suivants : 18,1 ; 16 et 18,0^{[réf. nécessaire]}. Leur GC% est compris entre 51 et 63.

Corynebacterium groupe G isolée de la peau.

Pathogénicité

• Corynebacterium diphteriae l'agent de la diphtérie, une toxi-infection gravissime due à la production de la toxine diphtérique.
• Corynebacterium ulcerans responsable de suppurations chez les diabétiques. Certaines souches produisent la toxine diphtérique.
• Corynebacterium minutissimum : responsable de l'érythème des plis (érythrasma), bien sensible aux macrolides
• responsable des trichobactérioses

Les corynébactéries sont souvent des agents de souillure des hémocultures. Il faut discuter de leur implication dans une bactériémie éventuelle en fonction de l'espèce (Corynebacterium jeikeium, Corynebacterium striatum^[1] et les souches de Corynebactéries du groupe G qui sont des agents d'endocardite) et du contexte clinique (patient avec cathéter veineux ou artériel, chambre implantable).

Liste d'espèces

Espèces validement publiées

Selon la LPSN (26 novembre 2022)^[2] :

• Corynebacterium accolens Neubauer et al. 1991
• Corynebacterium afermentans Riegel et al. 1993
• Corynebacterium alimapuense Claverias et al. 2019
• Corynebacterium ammoniagenes (Cooke & Keith 1927) Collins 1987
• Corynebacterium amycolatum Collins et al. 1988
• Corynebacterium anserum Liu et al. 2021
• Corynebacterium appendicis Yassin et al. 2002
• Corynebacterium aquatimens Aravena-Román et al. 2012
• Corynebacterium aquilae Fernández-Garayzábal et al. 2003
• Corynebacterium argentoratense Riegel et al. 1995
• Corynebacterium atrinae Kim et al. 2015
• Corynebacterium atypicum Hall et al. 2003
• Corynebacterium aurimucosum Yassin et al. 2002
• Corynebacterium auris Funke et al. 1995
• Corynebacterium auriscanis Collins et al. 2000
• Corynebacterium belfantii Dazas et al. 2018
• Corynebacterium beticola Abdou 1969
• Corynebacterium bovis Bergey et al. 1923
• Corynebacterium callunae (Lee & Good 1963) Yamada & Komagata 1972
• Corynebacterium camporealense corrig. Fernández-Garayzábal et al. 1998
• Corynebacterium canis Funke et al. 2010
• Corynebacterium capitovis Collins et al. 2001
• Corynebacterium casei Brennan et al. 2001
• Corynebacterium caspium Collins et al. 2004
• Corynebacterium choanae Busse et al. 2019
• Corynebacterium ciconiae Fernández-Garayzábal et al. 2004
• Corynebacterium comes Schaffert et al. 2021
• Corynebacterium confusum Funke et al. 1998
• Corynebacterium coyleae Funke et al. 1997
• Corynebacterium crudilactis Zimmermann et al. 2016
• Corynebacterium cystitidis Yanagawa & Honda 1978
• Corynebacterium deserti Zhou et al. 2012
• Corynebacterium diphtheriae (Kruse 1886) Lehmann & Neumann 1896 – espèce type
• Corynebacterium doosanense Lee et al. 2009
• Corynebacterium durum Riegel et al. 1997
• Corynebacterium efficiens Fudou et al. 2002
• Corynebacterium endometrii Ballas et al. 2020
• Corynebacterium epidermidicanis Frischmann et al. 2012
• Corynebacterium faecale Chen et al. 2016
• Corynebacterium falsenii Sjödén et al. 1998
• Corynebacterium felinum Collins et al. 2001
• Corynebacterium flavescens Barksdale et al. 1979
• Corynebacterium fournieri corrig. Diop et al. 2018
• Corynebacterium frankenforstense Wiertz et al. 2013
• Corynebacterium freiburgense Funke et al. 2009
• Corynebacterium freneyi Renaud et al. 2001
• Corynebacterium gerontici Busse et al. 2019
• Corynebacterium glaucum Yassin et al. 2003
• Corynebacterium glucuronolyticum Funke et al. 1995
• Corynebacterium glutamicum (Kinoshita et al. 1958) Abe et al. 1967
• Corynebacterium glyciniphilum (ex Kubota et al. 1972) Al-Dilaimi et al. 2015
• Corynebacterium gottingense Atasayar et al. 2017
• Corynebacterium guangdongense Li et al. 2016
• Corynebacterium halotolerans Chen et al. 2004
• Corynebacterium hansenii Renaud et al. 2007
• Corynebacterium heidelbergense Braun et al. 2021
• Corynebacterium hindlerae Bernard et al. 2021
• Corynebacterium humireducens Wu et al. 2011
• Corynebacterium ilicis Mandel et al. 1961
• Corynebacterium imitans Funke et al. 1997
• Corynebacterium jeddahense Edouard et al. 2017
• Corynebacterium jeikeium Jackman et al. 1988
• Corynebacterium kalinowskii Schaffert et al. 2021
• Corynebacterium kroppenstedtii Collins et al. 1998
• Corynebacterium kutscheri (Migula 1900) Bergey et al. 1925
• Corynebacterium lactis Wiertz et al. 2013
• Corynebacterium liangguodongii Zhu et al. 2020
• Corynebacterium lipophiloflavum Funke et al. 1997
• Corynebacterium lizhenjunii Zhou et al. 2021
• Corynebacterium lowii Bernard et al. 2016
• Corynebacterium lubricantis Kämpfer et al. 2009
• Corynebacterium lujinxingii Zhang et al. 2021
• Corynebacterium macginleyi Riegel et al. 1995
• Corynebacterium marinum Du et al. 2010
• Corynebacterium maris Ben-Dov et al. 2009
• Corynebacterium massiliense Merhej et al. 2009
• Corynebacterium mastitidis Fernandez-Garayzabal et al. 1997
• Corynebacterium matruchotii (Mendel 1919) Collins 1983
• Corynebacterium minutissimum (ex Sarkany et al. 1962) Collins & Jones 1983
• Corynebacterium mucifaciens Funke et al. 1997
• Corynebacterium mustelae Funke et al. 2010
• Corynebacterium mycetoides (ex Castellani 1942) Collins 1983
• Corynebacterium nasicanis Baumgardt et al. 2015
• Corynebacterium nuruki Shin et al. 2011
• Corynebacterium occultum Schaffert et al. 2021
• Corynebacterium oculi Bernard et al. 2016
• Corynebacterium otitidis (Funke et al. 1994) Baek et al. 2018
• Corynebacterium parakroppenstedtii Luo et al. 2022
• Corynebacterium pelargi Kämpfer et al. 2015
• Corynebacterium phocae Pascual et al. 1998
• Corynebacterium pilbarense Aravena-Roman et al. 2010
• Corynebacterium pilosum Yanagawa & Honda 1978
• Corynebacterium pollutisoli Negi et al. 2016
• Corynebacterium propinquum Riegel et al. 1994
• Corynebacterium pseudodiphtheriticum Lehmann & Neumann 1896
• Corynebacterium pseudokroppenstedtii Luo et al. 2022
• Corynebacterium pseudopelargi Busse et al. 2019
• Corynebacterium pseudotuberculosis (Buchanan 1911) Eberson 1918
• Corynebacterium pyruviciproducens Tong et al. 2010
• Corynebacterium qintianiae Zhou et al. 2021
• Corynebacterium renale (Migula 1900) Ernst 1906
• Corynebacterium resistens Otsuka et al. 2005
• Corynebacterium riegelii Funke et al. 1998
• Corynebacterium rouxii Badell et al. 2020
• Corynebacterium sanguinis Jaén-Luchoro et al. 2020
• Corynebacterium silvaticum Dangel et al. 2020
• Corynebacterium simulans Wattiau et al. 2000
• Corynebacterium singulare Riegel et al. 1997
• Corynebacterium sphenisci Goyache et al. 2003
• Corynebacterium spheniscorum Goyache et al. 2003
• Corynebacterium sputi Yassin & Siering 2008
• Corynebacterium stationis (ZoBell & Upham 1944) Bernard et al. 2010
• Corynebacterium striatum (Chester 1901) Eberson 1918
• Corynebacterium suicordis Vela et al. 2003
• Corynebacterium sundsvallense Collins et al. 1999
• Corynebacterium suranareeae Nantapong et al. 2020
• Corynebacterium tapiri Baumgardt et al. 2015
• Corynebacterium terpenotabidum Takeuchi et al. 1999
• Corynebacterium testudinoris Collins et al. 2001
• Corynebacterium thomssenii Zimmermann et al. 1998
• Corynebacterium timonense Merhej et al. 2009
• Corynebacterium trachiae Kämpfer et al. 2015
• Corynebacterium tuberculostearicum Feurer et al. 2004
• Corynebacterium tuscaniense corrig. Riegel et al. 2006
• Corynebacterium ulcerans (ex Gilbert & Stewart 1927) Riegel et al. 1995
• Corynebacterium ulceribovis Yassin 2009
• Corynebacterium urealyticum Pitcher et al. 1992
• Corynebacterium ureicelerivorans Yassin 2007
• Corynebacterium urinipleomorphum corrig. Niang et al. 2021
• Corynebacterium urogenitale Ballas et al. 2020
• Corynebacterium uropygiale Braun et al. 2016
• Corynebacterium uterequi Hoyles et al. 2013
• Corynebacterium variabile corrig. (Müller 1961) Collins 1987
• Corynebacterium vitaeruminis corrig. (Bechdel et al. 1928) Lanéelle et al. 1980
• Corynebacterium wankanglinii Zhang et al. 2021
• Corynebacterium xerosis (Lehmann & Neumann 1896) Lehmann & Neumann 1899
• Corynebacterium yudongzhengii Zhu et al. 2020
• Corynebacterium zhongnanshanii Zhang et al. 2021

Espèces reclassées (synonymes)

Selon la LPSN (26 novembre 2022)^[2] les espèces suivantes ont été reclassées :

• Corynebacterium betae Keyworth et al. 1956 : reclassée en Curtobacterium flaccumfaciens (Hedges 1922) Collins & Jones 1984
• Corynebacterium equi Magnusson 1923 : reclassée en Rhodococcus equi (Magnusson 1923) Goodfellow & Alderson 1977
• Corynebacterium fascians (Tilford 1936) Dowson 1942 : reclassée en Rhodococcus fascians (Tilford 1936) Goodfellow 1984
• Corynebacterium flaccumfaciens (Hedges 1922) Dowson 1942 : reclassée en Curtobacterium flaccumfaciens (Hedges 1922) Collins & Jones 1984
• Corynebacterium godavarianum Jani et al. 2018 : reclassée en C. gottingense Atasayar et al. 2017
• Corynebacterium hadale Wei et al. 2018 : reclassée en C. gottingense Atasayar et al. 2017
• Corynebacterium hoagii (Morse 1912) Eberson 1918 : reclassée en Rhodococcus hoagii (Morse 1912) Kämpfer et al. 2014
• Corynebacterium insidiosum (McCulloch 1925) Jensen 1934 : reclassée en Clavibacter insidiosus (McCulloch 1925) Li et al. 2018
• Corynebacterium iranicum (ex Scharif 1961) Carlson & Vidaver 1982 : reclassée en Rathayibacter iranicus (Carlson & Vidaver 1982) Zgurskaya et al. 1993
• Corynebacterium lilium Lee & Good 1963 : reclassée en C. glutamicum (Kinoshita et al. 1958) Abe et al. 1967
• Corynebacterium liquefaciens (Okabayashi & Masuo 1960) Lanéelle et al. 1980 : reclassée en Glutamicibacter nicotianae (Giovannozzi-Sermanni 1959) Busse 2016
• Corynebacterium michiganense (Smith 1910) Jensen 1934 : reclassée en Clavibacter michiganensis corrig. (Smith 1910) Davis et al. 1984
• Corynebacterium mooreparkense Brennan et al. 2001 : reclassée en C. variabile corrig. (Müller 1961) Collins 1987
• Corynebacterium nebraskense Vidaver & Mandel 1974 : reclassée en Clavibacter nebraskensis (Vidaver & Mandel 1974) Li et al. 2018
• Corynebacterium nigricans Shukla et al. 2004 : reclassée en C. aurimucosum Yassin et al. 2002
• Corynebacterium oortii Saaltink & Maas Geesteranus 1969 : reclassée en Curtobacterium flaccumfaciens (Hedges 1922) Collins & Jones 1984
• Corynebacterium paurometabolum Steinhaus 1941 : reclassée en Tsukamurella paurometabola corrig. (Steinhaus 1941) Collins et al. 1988
• Corynebacterium poinsettiae (Starr & Pirone 1942) Burkholder 1948 : reclassée en Curtobacterium flaccumfaciens (Hedges 1922) Collins & Jones 1984
• Corynebacterium pyogenes (Glage 1903) Eberson 1918 : reclassée en Trueperella pyogenes (Glage 1903) Yassin et al. 2011
• Corynebacterium rathayi (Smith 1913) Dowson 1942 : reclassée en Rathayibacter rathayi (Smith 1913) Zgurskaya et al. 1993
• Corynebacterium seminale Riegel et al. 1996 : reclassée en C. glucuronolyticum Funke et al. 1995
• Corynebacterium sepedonicum (Spieckermann & Kotthoff 1914) Skaptason & Burkholder 1942 : reclassée en Clavibacter sepedonicus (Spieckermann & Kotthoff 1914) Li et al. 2018
• Corynebacterium tritici (ex Hutchinson 1917) Carlson & Vidaver 1982 : reclassée en Rathayibacter tritici (Carlson & Vidaver 1982) Zgurskaya et al. 1993

Notes et références

1. « Infective Endocarditis Due to Corynebacterium Species: Clinical Features and Antibiotic Resistance »
2. List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), consulté le 26 novembre 2022

Voir aussi

Biographie

• P. Riegel (2006), Actualités de l′épidémiologie et du rôle pathogène des corynébactéries ; Antibiotiques, Volume 8, Issue 3, Sept. 2006, Pages 153-161 (résumé)