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En 1998, elle se tourne vers le documentaire et coréalise avec Rémi LainéBrigade des mineurs : L’amour en souffrance (un 90 minutes pour France3) ainsi que Ma petite chérie (pour l'émission Strip-tease). La cinéaste Maïwenn s'inspirera en partie de ces films pour l'écriture de Polisse (Prix spécial du jury à Cannes 2011). Christine François réalisera avec le même coauteur Le Mal de grandir : Passages d’adolescents en psychiatrie en 2000.
En 2002, elle écrit et tourne, avec la comédienne Jade Duviquet, un documentaire sur le deuil et la filiation, Le Chemin de jade (production Adalios).
2011 : Le secret de l'enfant fourmi, sélectionné dans les avant-premières Paris-Cinéma 2011, au Fespaco 2013, Louxor 2013, Vancouver 2012, Montréal 2011, Hambourg 2012...
2004 : J'ai deux mamans, mention spéciale du jury au Festival du film de femmes de Turin.
2000 : Mina ne veut plus jouer, Psy d'or au Festival de Lorquin
1998 : Brigade des mineurs:l'amour en souffrance, catégorie Coups de cœur, Lussas 1998
1995 : Le Poids du corps, Grand prix média de la Fondation pour l'Enfance
1992 : Le Poids du corps, lauréat des Écrans de la Télévision publique, catégorie premières œuvres.