Les premières mentions de la chapelle datent des années 1549-1550.
Évolution du bâtiment
XIIe siècle
Un oratoire est fondé sur le lieu d'une apparition de la Vierge
XVIIe siècle
En 1660, un séisme détruit partiellement l'oratoire.
XVIIIe siècle
Situé sur la via Tolosane des chemins de Compostelle, l'oratoire est transformé en une église en 1717, du fait de l'affluence des pèlerins de plus en plus nombreux. Pendant la Révolution, l'édifice est utilisé comme caserne, puis vendu comme bien national en 1795.
L'église est rouverte en 1808, à la suite de l’intervention d’Hortense de Beauharnais auprès de l’Empereur pour célébrer une messe anniversaire le , en mémoire de son fils aîné décédé, Napoléon Louis Charles Bonaparte.
C’est l’évêque de Tarbes, MgrLaurence, qui entreprit la restauration et confia la gestion aux pères de Garaison, comme à Héas.
XIXe siècle
Entre 1812 et 1813 au cours de la Guerre d'Espagne qui opposa la France et l'Espagne, le sanctuaire se transforme à nouveau en caserne. En 1856, les Pères de Notre-Dame-de-Garaison ouvrent un collège qui donna au diocèse une cinquantaine de prêtres.
XXe siècle
Un sanatorium est ouvert après la guerre de 1914-1918 dans les locaux de l’ancien noviciat des Missionnaires de l’Immaculée Conception (Pères de Notre-Dame-de-Garaison) puis transformé en 1973, en institut médical.
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