Asprónissi a une forme ovale orientée selon un axe nord-est-sud-ouest. Mesurant environ 650 mètres de longueur pour environ 200 mètres de largeur, l'île culmine à environ 70 mètres d'altitude sous la forme d'un plateau. Ses côtes rocheuses sont escarpées et dénudées tandis que le sommet de l'île est recouvert d'herbes éparses. Sa topographie fait que l'île est difficile d'accès, tant par voie maritime qu'aérienne.
Les roches à la base de l'île sont des laves de couleur sombre tandis que sa partie supérieure est constituée d'un tuf[2] de poncesindurées formant une épaisse couche blanche. cette couleur claire prédominante lui a donné son nom, le terme grecAsprónissi signifiant en français « île blanche ».