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Après avoir fait ses débuts à l'âge de 19 ans en 1996 il accumulé plus de 1600 coups sûrs et plus de 360 coups de circuit. Le il est devenu le joueur le plus jeune ayant frappé un circuit en Série mondiale à 19 ans et 6 mois[1].
Depuis 1996, Jones a accumulé plus de 100 points produits en 5 saisons différentes, dont 128 en 2005. En 2005, il frappe 51 coups de circuits pour les Braves, dépassant le record de Hank Aaron et Eddie Mathews qui avaient frappé 47 circuits avec les Braves (Mathews en 1953, Aaron en 1971). Avec 154 coups sûrs, 24 doubles, 51 circuits et 128 points produits, Jones finit second lors du vote pour le meilleur joueur derrière Albert Pujols. En 2006, Jones produit 129 points avec 107 points et une moyenne au bâton de ,262. Il finit 11e lors du vote pour le meilleur joueur.
En 2007, ses performances offensives baissent et il ne frappe qu'avec une moyenne de ,222 avec 26 circuits et 94 points produits. À l'issue de sa dernière année de contrat et après 13 saisons au sein de la même franchise, les Braves ne le resignent pas pour la saison 2008 et il devient agent libre le . Le 5 décembre, il signe un contrat de 2 saisons pour un montant de 36,2 millions de dollars américains avec les Dodgers de Los Angeles[2].
En 2009, il a signé un contrat de ligues mineures avec les Rangers du Texas[3].
