Fils de l'écrivain et scénariste Iouri Guerman, Alexeï Guerman entre aux studios Lenfilm en 1964[2]. Bien qu'il soit considéré comme l'un des plus grands réalisateurs russes de la seconde moitié du XXe siècle, il n'a réalisé que six films en plus de quarante ans, dont deux inspirés des écrits de son père. Trois de ses œuvres ont été censurées — La Vérification (1971) et les deux films cités plus bas — et n'ont pu sortir qu'au moment de la perestroïka[3]. Tous ses films ont été tournés dans les studios Lenfilm à Saint-Pétersbourg, dont il fut un temps administrateur. Alexeï Guerman commence sa carrière au théâtre, puis coréalise, avec Grigori Aronov, Le Septième Compagnon (1967), adapté d'une nouvelle de Boris Lavrenev.
Le , il est décoré de l'Ordre de l'Honneur pour sa contribution au développement du cinéma national.
Il est difficile d'être un dieu, son sixième et dernier film, dont le mixage, après sa mort, sera terminé par son fils Alexeï[1], est l'adaptation du roman des frères Arcadi et Boris Strougatski, Il est difficile d'être un dieu (L'Histoire du carnage d'Arkanar, Paris, Denoël, 1973). Il s'agit d'une réflexion philosophique sur la marche de l'Histoire et les rapports de pouvoir[4]. Le film est récompensé par sept prix Nika en 2015 dont celui du meilleur réalisateur décerné à titre posthume.
Alexeï Guerman tournait ses films en noir et blanc car « les souvenirs n'ont pas de couleur »[5].
Le réalisateur est décédé d'insuffisance rénale le . Il est inhumé au cimetière Bogoslovskoïe de Saint-Pétersbourg.