L'ancienne église est démolie en 1662 pour laisser la place à une église plus grande qui est elle-même reconstruite en 1786-1789 par Franz Arnold Boner. Cette église-halle est à cinq travées de style baroque aux impostes puissants. Elle est surmontée d'un clocheton polygonal. La travée-est et le chœur sont agrandis en 1861 et les piliers sont redécorés de stuc. Le fronton-ouest est orné d'une grande fenêtre à arc rond et d'une niche abritant une statue de la Vierge Marie, œuvre de Joseph Wäscher. Les peintures intérieures ont été restaurées en 1953, la peinture du maître-autel date de 1982. On remarque une statue de saint François d'Assise sur l'abat-voix de la chaire décorée des quatre Évangélistes.
L'église est depuis 1848 desservie par les franciscains du couvent de Werl. Devenue trop petite pour les pèlerinages à Notre-Dame de Werl, elle est remplacée en 1911 par la nouvelle basilique de la Visitation de Werl, bâtie à gauche de l'ancienne église des capucins, qui est aussi desservie par les franciscains. C'est dans cette nouvelle basilique qu'affluent désormais les groupes de pèlerins devant la statuette de Notre-Dame Consolatrice des Affligés.