La nef est actuellement la partie la plus ancienne de l'église, construite vers la 2e moitié du XIe siècle. À la fin du XIe siècle sont érigés le clocher, les bras et croisée du transept. La chapelle nord date du milieu XIIe siècle et le chœur se trouve à la limite entre les XIIe siècle et XIIIe siècle. La chapelle sud est construite au XVe siècle. Le bas-côté sud est ajouté au début du 2e quart du XVIe siècle, la 3e travée est construite probablement par Jean de Lespine en 1532 et 1533. Le croisillon sud est revoûté d'un berceau à caissons, portant les armes de la famille Tillon de Coutrolles vers le milieu du XVIe siècle. Le bas-côté sud s'effondre en 1806. Le lambris de bois blanc qui couvre actuellement la nef a été posé en 1826. La flèche est reconstruite en 1856, mais fut endommagée à deux reprises en 1859 et 1892. Celle-ci est alors remplacée par un clocher en charpente.
Architecture
Le clocher tors possède une forme hélicoïdale de gauche à droite de 1/8e de tour, construit volontairement. Cependant, l'inclinaison de la flèche semble due à un mauvais séchage.
Jacques Mallet, « L'église du Vieil-Baugé », dans Congrès archéologique de France. 122e session. Anjou. 1964, Paris, Société française d'archéologie, (lire en ligne), p. 171-185