Magdalene College on yksi englantilaisenCambridgen yliopiston 31 collegesta. Vuonna 1428 Crowland Abbeyn apotti Lytlington sai kuningas Henrik VI:lta luvan perustaa hostellin (engl.Monks' Hostel) benediktiinimunkkioppilaille. 1400-luvun lopulla instituution nimi vaihtui Buckingham Collegeksi, sillä collegen suojelijana toimi Henry Stafford, Buckinghamin 2. herttua. Hänet kuitenkin tuomittiin maanpetoksesta ja teloitettiin vuonna 1483.[3]
Edward Stafford, Buckinghamin 3. herttua, rakennutti collegen ruokasalin vuonna 1519. Kuten isänsä Henry aiemmin, hänetkin teloitettiin maanpetoksesta vuonna 1521. Vuonna 1542 lordi Thomas Audley perusti collegen uudelleen nimellä College of St Mary Magdalene[4]Magdalan Marian mukaan.[5] Uudelleen perustaminen tuli mahdolliseksi kuningas Henrik VIII:n toimeenpantua luostareiden lakkauttamisen, minkä seurauksena Thomas Audley oli saanut haltuunsa yhden collegelle kuuluneista luostarirakennuksista.[4]
Magdalene College oli Cambridgen ja Oxfordin yksinomaan miehille tarkoitetuista collegeista viimeinen, joka alkoi hyväksyä naisia opiskelijoiksi – päätös naisten hyväksymisestä tehtiin vuonna 1986 ja naisopiskelijat aloittivat opintonsa collegessa vuonna 1988.[6] Nykyään 48 % opiskelijoista on naisia.[7]