Hiller opiskeli Dresdenissä ja oppi hallitsemaan monien instrumenttien soiton[2] sekä laulun[1] ennen kuin muutti Leipzigiin opiskellakseen lyhyesti[1]oikeustiedettä.[2] Hilleristä tuli aktiivinen toimija Leipzigin musiikkielämässä: hän muun muassa työskenteli vuosina 1781–1785 Gewandhausin konserttien kapellimestarina ja perusti laulukoulun.[1] Hänellä oli myös lyhytaikainen virka Kuurinmaan herttuan hovissa, ja hän lähti tämän jälkeen Breslauhun, josta palasi Leipzigiin.[2] Leipzigissa Hiller toimi vuosina 1789–1800 Thomaskirchen kanttorina (tuomaskanttori). Hillerin säveltämien singspielien joukossa ovat Die Liebe auf dem Lande (1768) ja Die Jagd (1770). Hän sävelsi myös lauluja ja kirkkomusiikkia.[1] Muuhun musiikkituotantoon kuuluu esimerkiksi instrumentaaliteoksia. Lisäksi Hiller tuli tunnetuksi musiikkiaiheisella tutkimuskirjallisuudellaan.[2]
Huomattavan suosion näyttämömusiikillaan saavuttanut Hiller sai melodioihinsa vaikutteita Johann Adolf Hasselta, jonka työhön hän oli tutustunut Dresdenissä.[2]
