لیگ برتر فوتبال استونی ۲۰۰۱ (انگلیسی: 2001 Meistriliiga) یازدهمین فصل لیگ برتر فوتبال استونی است که با قهرمانی باشگاه فوتبال فلورا تالین به پایان رسیدهاست.
تیم لوتوس پس از تساوی در دو دیدار با گل زده در خانه حریف سهمیه شرکت در لیگ برتر فوتبال استونی ۲۰۰۲ را حفظ کرد.