شهرستان هرکیمر (به انگلیسی: Herkimer County) واقع در ایالت نیویورک است. جمعیت این شهرستان بر اساس سرشماری سال ۲۰۱۰ آمریکا ۶۴۵۱۹ نفر گزارش شدهاست.[۱]مرکز شهرستان هرکیمر شهر هرکیمر است.[۲]این شهرستان در سال ۱۷۹۱ بنیانگذاری شده و به افتخار جنرال نیکولاس هرکیمر که از شدت جراحت در طی جنگهای استقلال آمریکا در ۱۷۹۱ درگذشت، هرکیمر نام گرفتهاست.[۳]