Johann Georg Ernst von Grünewaldt abiellus 1862. aastal oma onutütre Elsbeth von Grünewaldtiga, Elsbethi isa oli Esna mõisa omanik ja Ernsti isa vend Alexander von Grünewaldt (1805–1886). Elsbethi ema oli paruness Pauline von Ungern-Sternberg. Abielust sündisid:
Georg August Arthur von Grünewaldt (1868–1929), baltisaksa poliitik, õppis Tartu Ülikoolis õigusteadust ja agronoomiat 1886–1889, reservlipnik, kreisisaadik Virumaalt, 1897. aastast Triigi mõisa (Ottenküll) omanik
Pauline Mathilde Bertha von Grünewaldt (28. detsember 1870 Koigi – 23. märts 1874 Koigi)