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El sistema Engler es un sistema de clasificación de plantas y el primero concebido como filogenético, después de que Darwin difundiera su Teoría de la Selección Natural. Fue desarrollado por el botánico alemán Adolf Engler con una primera edición en 1892, y fue continuado por colaboradores hasta su última edición en 1964, editada por Melchior.

Debido a las lagunas de conocimientos en anatomía y biología molecular de las plantas en esa época, el sistema está basado principalmente en rasgos morfológicos de acceso relativamente sencillo a través de una lupa y un microscopio.

Si bien este sistema de clasificación ya no es considerado filogenético, se sigue enseñando principalmente porque muchos libros de taxonomía de plantas están ordenados según este sistema.

Este sistema concibe una circunscripción tradicionalista del reino Plantae. En una época en que todos los seres vivos eran o plantas o animales, el sistema de clasificación acogió como plantas a todos los organismos con capacidad de fotosintetizar y a los organismos sin motilidad, a saber:

- Algunos tipos de bacterias (que en la clasificación por 5 reinos pertenecen al reino Monera que agrupa a todos los procariotas, mientras que en la clasificación más moderna las bacterias están divididas en reinos Bacteria y Archaea).
- Los hongos, que hoy se sabe que están más emparentados con los animales que con las plantas, y en la clasificación por 5 reinos pertenecen a su propio reino Fungi.
- Diferentes tipos de "algas", definidas como organismos eucariotas con cloroplastos, que en la clasificación por 5 reinos pertenecen o bien al reino Protista o bien al reino Plantae si son multicelulares, y hoy se sabe que pertenecen a varias líneas filogenéticas no emparentadas.
- Las "algas rojas" (Rhodophyta), las "algas verdes" (Chlorophyceae y Charophyta) y las plantas terrestres (Embryophyta asiphonogama y Embryophyta siphonogama), teniendo todas ellas un antecesor común según los últimos estudios moleculares.

Cada sistema de clasificación filogenético refleja las teorías evolutivas de la época, y el sistema de Engler no es la excepción. Engler concibió al reino de las Plantas como compuesto por Divisiones de organismos fotosintéticos o sin motilidad cada vez más complejos, siendo los más complejos descendientes de los más sencillos.

Si bien los conocimientos de la época no le permitieron tener muchos aciertos en las divisiones "inferiores" del reino Plantae (divisiones cuyo uso tal como lo concibió Engler está prácticamente descartado hoy en día), los estudios moleculares actuales han consensuado la monofilia de varias divisiones. También los estudios moleculares han consensuado la parafilia de otras divisiones, aunque Engler las hubiera concebido como monofiléticas, las agrupaciones parafiléticas son consideradas útiles y son validadas por muchos autores. En el caso particular de la división Gymnospermae, cuya monofilia fue muy discutida en los últimos años y de hecho descartada por otros sistemas posteriores como el de Cronquist, a la fecha de edición de este artículo (diciembre del 2006) está prácticamente consensuado que es monofilética. También su división Angiospermae fue consensuada como monofilética prácticamente en todos los sistemas de clasificación filogenéticos, hoy en día confirmada por los estudios moleculares, si bien hoy es más utilizado en algunas áreas su sinónimo Magnoliophyta. Dentro de la división Angiospermae, es interesante su hipótesis sobre la evolución de la flor. Engler concibió a las Gnetopsidas (una clase de gimnospermas con muchos rasgos derivados parecidos a los de las angiospermas) como poseedoras de la flor ancestral, por lo que hipotetizó que la angiosperma ancestral tenía flores en inflorescencias, que no tenían perianto, olor ni color, y que se polinizaban a través del viento. Por lo tanto, las flores con perianto serían más recientes que las aperiantadas (en particular las flores que sólo tienen sépalos serían más antiguas que las que tienen sépalos y pétalos), y la unión de los pétalos entre sí habría sido un suceso evolutivo posterior. Por lo tanto la cantidad de pétalos y sépalos en las flores, y si están unidos entre sí o no, serían rasgos que reflejan la posición de la planta en el árbol filogenético. Si bien hoy en día están descartadas todas estas hipótesis del origen y la evolución de la flor, esta clasificación utiliza un carácter muy conspicuo para la determinación (cantidad y connación de pétalos y sépalos), por lo que sigue resultando "cómoda" para varios investigadores.

Divisiones del reino Plantae

De acuerdo con Engler & Glig, en su libro Syllabus der Pflanzenfamilien (1924), los grupos principales de plantas son

reino Plantae
I. divisio Schizophyta
II. divisio Phytosarcodina
III. divisio Flagellatae
IV. divisio Dinoflagellatae
V. divisio Bacillariophyta
VI. divisio Conjugatae
VII. divisio Chlorophyceae
VIII. divisio Charophyta
IX. divisio Phaeophyceae
X. divisio Rhodophyceae (Bangiales, Florideae)
XI. divisio Eumycetes
XII. divisio Embryophyta asiphonogama
1 subdivisio Bryophyta (Filicales, Musci)

2 subdivisio Pteridophyta (Hepaticae, Articulatae, Lycopodiales, Ptilotales, Ispetales)
XIII. divisio Embryophyta siphonogama
1 subdivisio Gymnospermae (Cycadofilicales, Cycadales, Bennettitales, Ginkgoales, Coniferae, Cordaitales, Gnetales)

2 subdivisio Angiospermae
1 classis Monocotyledoneae

2 classis Dicotyledoneae

Las relaciones de las embriofitas con los grupos monofiléticos están explicitadas en el siguiente cuadro:

**Árbol filogenético actualizado** de los diferentes grupos de embriofitos.

Pteridophyta

La clasificación de la clase Filicopsida de las pteridofitas sensu Engler aceptada es (nota: la lista puede estar incompleta):

2 subdivisio Pteridophyta

1 classis Psilotopsida
ordo Psilotales
familia Psilotaceae

2 classis Sphenopsida
ordo Equisetales
familia Equisetaceae

3 classis Lycopsida
ordo Lycopodiales
familia Lycopodiaceae

ordo Selaginellales
familia Selaginellaceae

ordo Isoetales
familia Isoetaceae

4 classis Filicopsida
1 subclassis Marattidae
ordo Marattiales
familia Marattiaceae

2 subclassis Ophioglossidae
ordo Ophioglossales
familia Ophioglossaceae

3 subclassis Osmundidae
ordo Osmundales
familia Osmundaceae

4 subclassis Filicidae
01 ordo Schizaeales
familia Schizaeaceae

02 ordo Hymenophyllales
familia Hymenophyllaceae

03 ordo Dicksoniales
familia Dicksoniaceae

familia Thyrsopteridaceae

familia Dennstaedtiaceae

04 ordo Cyatheales
familia Cyatheaceae

familia Lophosoriaceae

05 ordo Gleicheniales
familia Gleicheniaceae

06 ordo Pteridales
familia Adiantaceae

familia Parkeriaceae

familia Vittariaceae

07 ordo Davalliales
familia Davalliaceae

08 ordo Aspidiales
familia Aspidiaceae

familia Aspleniaceae

familia Athyriaceae

familia Lomariopsidaceae

familia Thelypteridaceae

09 ordo Blechnales
familia Blechnaceae

10 ordo Polypodiales
familia Polypodiaceae

familia Grammitidaceae

5 subclassis Marsileidae
ordo Marsileales
familia Marsileaceae

6 subclassis Salviniidae
ordo Salviniales
familia Salviniaceae

familia Azollaceae

Angiospermae

La clasificación de las angiospermas de acuerdo con la última edición del Syllabus der Pflanzenfamilien (12.ª edición, 1964), también considerado como "sistema Melchior" o "sistema Engler modificado", es la siguiente: