Muñoz debutó en Atlético Tucumán en el año 1958. En su primer año se coronó campeón tucumano, alternando titularidades con suplencias.[2] Con la partida de Raúl González a Newells, se consolidó como titular en 1959 cuando se consagró campeón tucumano y donde se consagró como vencedor del Campeonato de Campeones de la República Argentina, obteniendo el primer título nacional del decano.[3][4][5] En 1960 gana nuevamente la Liga Tucumana llegando a anotar 39 goles entre 1959 y 1960.[6][7][8]
Volvió a Atlético Tucumán en 1962. Muñoz se consagró campeón tucumano en 1962, 1963 y 1964 consiguiendo así, el octacampeonto para la institución y se retiraría del fútbol. El "tanque" fue campeón con Atlético en todos sus años como jugador del club.[13][14]