El Campeonato Nacional de Cuarta División de Chile de 2003 fue la edición número 21 del torneo de la categoría.
Participaron 12 equipos, que jugaron en un sistema de todos-contra-todos agrupados en dos grupos: Norte y Sur en una primera fase. Luego de terminada esta fase, cinco primero equipos pasarán a una segunda fase, para definir a los cuatro semifinalistas, de donde salió el campeón para el año 2003.
Ferroviarios resultó ser el campeón de esta edición, y con esto, ascendió a la Tercera División. Acompañándolo, también ascendió San Bernardo Deportes como subcampeón.
Sin embargo por motivos de estructuración por parte de ANFA, la categoría fue absorbida al término de año por la Tercera División. Al descontinuarse, todos sus clubes fueron aceptados a la categoría superior hasta el año 2009
En la primera fase los 12 equipos se distribuyeron en dos grupos: Norte y Sur. El mejor equipo de cada grupo pasará a jugar un Play Offs entre sí para otorgar una bonificación especial de +3, los segundos lugares de cada grupo solo recibirán una bonificación de +1.
PJ=Partidos jugados; PG=Partidos ganados; PE=Partidos empatados; PP=Partidos perdidos; GF=Goles a favor; GC=Goles en contra; Dif=Diferencia de gol; Pts=Puntos
En esta segunda fase saldrán los dos equipos que disputaron los ascensos. Son dos grupos de 6 elencos cada uno, donde los dos primeros pasan a la siguiente etapa
Los cuatro clasificados disputarán llaves de ida y vuelta para definir al finalistas y posteriormente, el campeón .